Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Cldn34c3J3QJW5 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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