Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21060J3KMU4 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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