Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm20828J3KMI7 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.2 ms