Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arfgef1G3X9K3 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arfgef1G3X9K3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms