Protein–RNA interactions for Protein: F6VKC7

Zfp988, Zinc finger protein 988, mousemouse

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp988F6VKC7 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zfp988F6VKC7 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zfp988F6VKC7 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zfp988F6VKC7 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zfp988F6VKC7 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zfp988F6VKC7 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zfp988F6VKC7 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zfp988F6VKC7 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zfp988F6VKC7 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zfp988F6VKC7 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zfp988F6VKC7 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zfp988F6VKC7 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zfp988F6VKC7 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zfp988F6VKC7 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zfp988F6VKC7 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zfp988F6VKC7 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zfp988F6VKC7 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zfp988F6VKC7 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zfp988F6VKC7 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zfp988F6VKC7 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zfp988F6VKC7 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Zfp988F6VKC7 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Zfp988F6VKC7 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zfp988F6VKC7 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zfp988F6VKC7 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Zfp988F6VKC7 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zfp988F6VKC7 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zfp988F6VKC7 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zfp988F6VKC7 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zfp988F6VKC7 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zfp988F6VKC7 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zfp988F6VKC7 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zfp988F6VKC7 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zfp988F6VKC7 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Zfp988F6VKC7 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Zfp988F6VKC7 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Zfp988F6VKC7 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Zfp988F6VKC7 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Zfp988F6VKC7 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Zfp988F6VKC7 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Zfp988F6VKC7 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Zfp988F6VKC7 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Zfp988F6VKC7 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Zfp988F6VKC7 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Zfp988F6VKC7 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Zfp988F6VKC7 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Zfp988F6VKC7 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Zfp988F6VKC7 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Zfp988F6VKC7 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Zfp988F6VKC7 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Zfp988F6VKC7 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Zfp988F6VKC7 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Zfp988F6VKC7 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Zfp988F6VKC7 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Zfp988F6VKC7 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Zfp988F6VKC7 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Zfp988F6VKC7 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Zfp988F6VKC7 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Zfp988F6VKC7 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Zfp988F6VKC7 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Zfp988F6VKC7 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Zfp988F6VKC7 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Zfp988F6VKC7 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Zfp988F6VKC7 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Zfp988F6VKC7 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Zfp988F6VKC7 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Zfp988F6VKC7 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Zfp988F6VKC7 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Zfp988F6VKC7 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Zfp988F6VKC7 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Zfp988F6VKC7 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Zfp988F6VKC7 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Zfp988F6VKC7 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Zfp988F6VKC7 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Zfp988F6VKC7 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Zfp988F6VKC7 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Zfp988F6VKC7 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Zfp988F6VKC7 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Zfp988F6VKC7 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Zfp988F6VKC7 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Zfp988F6VKC7 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Zfp988F6VKC7 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Zfp988F6VKC7 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Zfp988F6VKC7 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Zfp988F6VKC7 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Zfp988F6VKC7 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Zfp988F6VKC7 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Zfp988F6VKC7 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Zfp988F6VKC7 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Zfp988F6VKC7 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Zfp988F6VKC7 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Zfp988F6VKC7 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Zfp988F6VKC7 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Zfp988F6VKC7 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Zfp988F6VKC7 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Zfp988F6VKC7 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Zfp988F6VKC7 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Zfp988F6VKC7 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zfp988F6VKC7 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Zfp988F6VKC7 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms