Protein–RNA interactions for Protein: F6Q785

Gm29094, Predicted gene 29094 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29094F6Q785 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm29094F6Q785 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm29094F6Q785 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm29094F6Q785 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm29094F6Q785 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm29094F6Q785 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm29094F6Q785 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm29094F6Q785 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm29094F6Q785 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm29094F6Q785 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm29094F6Q785 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm29094F6Q785 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm29094F6Q785 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm29094F6Q785 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm29094F6Q785 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm29094F6Q785 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm29094F6Q785 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm29094F6Q785 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm29094F6Q785 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm29094F6Q785 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm29094F6Q785 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm29094F6Q785 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm29094F6Q785 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm29094F6Q785 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm29094F6Q785 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm29094F6Q785 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm29094F6Q785 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm29094F6Q785 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm29094F6Q785 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm29094F6Q785 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm29094F6Q785 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm29094F6Q785 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm29094F6Q785 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm29094F6Q785 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm29094F6Q785 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm29094F6Q785 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm29094F6Q785 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm29094F6Q785 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm29094F6Q785 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm29094F6Q785 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm29094F6Q785 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm29094F6Q785 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm29094F6Q785 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm29094F6Q785 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm29094F6Q785 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm29094F6Q785 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm29094F6Q785 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm29094F6Q785 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm29094F6Q785 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm29094F6Q785 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm29094F6Q785 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm29094F6Q785 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm29094F6Q785 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm29094F6Q785 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm29094F6Q785 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm29094F6Q785 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm29094F6Q785 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm29094F6Q785 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm29094F6Q785 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm29094F6Q785 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm29094F6Q785 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm29094F6Q785 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm29094F6Q785 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm29094F6Q785 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm29094F6Q785 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm29094F6Q785 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm29094F6Q785 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm29094F6Q785 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm29094F6Q785 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm29094F6Q785 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm29094F6Q785 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm29094F6Q785 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm29094F6Q785 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm29094F6Q785 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm29094F6Q785 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm29094F6Q785 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm29094F6Q785 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm29094F6Q785 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm29094F6Q785 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm29094F6Q785 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm29094F6Q785 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm29094F6Q785 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm29094F6Q785 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm29094F6Q785 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm29094F6Q785 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm29094F6Q785 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm29094F6Q785 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm29094F6Q785 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm29094F6Q785 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm29094F6Q785 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm29094F6Q785 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm29094F6Q785 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm29094F6Q785 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm29094F6Q785 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm29094F6Q785 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm29094F6Q785 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm29094F6Q785 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm29094F6Q785 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm29094F6Q785 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm29094F6Q785 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms