Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccdc71lE9Q4T4 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms