Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1C7

Gm10471, Predicted gene 10471, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10471E9Q1C7 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm10471E9Q1C7 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm10471E9Q1C7 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm10471E9Q1C7 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm10471E9Q1C7 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm10471E9Q1C7 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm10471E9Q1C7 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm10471E9Q1C7 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm10471E9Q1C7 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm10471E9Q1C7 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm10471E9Q1C7 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm10471E9Q1C7 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm10471E9Q1C7 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm10471E9Q1C7 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm10471E9Q1C7 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm10471E9Q1C7 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm10471E9Q1C7 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm10471E9Q1C7 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm10471E9Q1C7 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm10471E9Q1C7 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm10471E9Q1C7 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm10471E9Q1C7 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm10471E9Q1C7 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm10471E9Q1C7 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
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Gm10471E9Q1C7 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
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Gm10471E9Q1C7 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm10471E9Q1C7 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm10471E9Q1C7 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
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Gm10471E9Q1C7 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm10471E9Q1C7 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm10471E9Q1C7 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm10471E9Q1C7 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm10471E9Q1C7 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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Gm10471E9Q1C7 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm10471E9Q1C7 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm10471E9Q1C7 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm10471E9Q1C7 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm10471E9Q1C7 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm10471E9Q1C7 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm10471E9Q1C7 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm10471E9Q1C7 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm10471E9Q1C7 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm10471E9Q1C7 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm10471E9Q1C7 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm10471E9Q1C7 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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Gm10471E9Q1C7 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm10471E9Q1C7 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm10471E9Q1C7 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm10471E9Q1C7 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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Gm10471E9Q1C7 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm10471E9Q1C7 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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Gm10471E9Q1C7 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm10471E9Q1C7 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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Gm10471E9Q1C7 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm10471E9Q1C7 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
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Gm10471E9Q1C7 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm10471E9Q1C7 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
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Gm10471E9Q1C7 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm10471E9Q1C7 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm10471E9Q1C7 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm10471E9Q1C7 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm10471E9Q1C7 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm10471E9Q1C7 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm10471E9Q1C7 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm10471E9Q1C7 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm10471E9Q1C7 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm10471E9Q1C7 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm10471E9Q1C7 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm10471E9Q1C7 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms