Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fndc1E9Q043 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.5 ms