Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc8E9PWG2 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms