Protein–RNA interactions for Protein: E9PW80

Gm3298, Predicted gene 3298, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3298E9PW80 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm3298E9PW80 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm3298E9PW80 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms