Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5W0

Atp6ap1l, ATPase, H+-transporting, lysosomal accessory protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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