Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms