Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

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Length 547 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Clip3B9EHT4 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms