Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Phf11bB4XVQ1 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Phf11bB4XVQ1 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms