Protein–RNA interactions for Protein: B2RXQ2

Ppfia1, Ppfia1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia1B2RXQ2 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppfia1B2RXQ2 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppfia1B2RXQ2 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppfia1B2RXQ2 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppfia1B2RXQ2 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppfia1B2RXQ2 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppfia1B2RXQ2 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppfia1B2RXQ2 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppfia1B2RXQ2 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppfia1B2RXQ2 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia1B2RXQ2 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia1B2RXQ2 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia1B2RXQ2 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia1B2RXQ2 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia1B2RXQ2 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia1B2RXQ2 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia1B2RXQ2 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia1B2RXQ2 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia1B2RXQ2 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia1B2RXQ2 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia1B2RXQ2 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia1B2RXQ2 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia1B2RXQ2 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia1B2RXQ2 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia1B2RXQ2 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia1B2RXQ2 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia1B2RXQ2 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia1B2RXQ2 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia1B2RXQ2 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia1B2RXQ2 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia1B2RXQ2 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia1B2RXQ2 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia1B2RXQ2 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia1B2RXQ2 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia1B2RXQ2 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia1B2RXQ2 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia1B2RXQ2 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia1B2RXQ2 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia1B2RXQ2 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia1B2RXQ2 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia1B2RXQ2 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia1B2RXQ2 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia1B2RXQ2 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfia1B2RXQ2 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia1B2RXQ2 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia1B2RXQ2 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia1B2RXQ2 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia1B2RXQ2 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia1B2RXQ2 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia1B2RXQ2 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia1B2RXQ2 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia1B2RXQ2 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia1B2RXQ2 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia1B2RXQ2 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia1B2RXQ2 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia1B2RXQ2 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia1B2RXQ2 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia1B2RXQ2 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia1B2RXQ2 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia1B2RXQ2 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia1B2RXQ2 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia1B2RXQ2 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia1B2RXQ2 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia1B2RXQ2 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia1B2RXQ2 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia1B2RXQ2 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia1B2RXQ2 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia1B2RXQ2 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia1B2RXQ2 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia1B2RXQ2 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia1B2RXQ2 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia1B2RXQ2 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia1B2RXQ2 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia1B2RXQ2 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia1B2RXQ2 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia1B2RXQ2 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia1B2RXQ2 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia1B2RXQ2 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia1B2RXQ2 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia1B2RXQ2 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia1B2RXQ2 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia1B2RXQ2 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia1B2RXQ2 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia1B2RXQ2 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia1B2RXQ2 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfia1B2RXQ2 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfia1B2RXQ2 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfia1B2RXQ2 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfia1B2RXQ2 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfia1B2RXQ2 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfia1B2RXQ2 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfia1B2RXQ2 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfia1B2RXQ2 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfia1B2RXQ2 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfia1B2RXQ2 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfia1B2RXQ2 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfia1B2RXQ2 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfia1B2RXQ2 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfia1B2RXQ2 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfia1B2RXQ2 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms