Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cfap58B2RW38 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cfap58B2RW38 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms