Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clrn2B2RVW2 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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