Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
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Rd3lB2RV38 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Rd3lB2RV38 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Rd3lB2RV38 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Rd3lB2RV38 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Rd3lB2RV38 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Rd3lB2RV38 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rd3lB2RV38 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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