Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Usf3B2RUQ2 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
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Usf3B2RUQ2 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Usf3B2RUQ2 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Usf3B2RUQ2 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms