Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Brpf1B2RRD7 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Brpf1B2RRD7 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms