Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Uhrf1bp1B2KF50 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Uhrf1bp1B2KF50 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms