Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprsB0V2N1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprsB0V2N1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprsB0V2N1 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprsB0V2N1 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprsB0V2N1 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprsB0V2N1 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprsB0V2N1 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprsB0V2N1 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprsB0V2N1 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprsB0V2N1 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprsB0V2N1 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprsB0V2N1 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprsB0V2N1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprsB0V2N1 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprsB0V2N1 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprsB0V2N1 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprsB0V2N1 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprsB0V2N1 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
PtprsB0V2N1 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprsB0V2N1 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprsB0V2N1 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprsB0V2N1 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprsB0V2N1 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprsB0V2N1 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprsB0V2N1 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprsB0V2N1 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprsB0V2N1 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprsB0V2N1 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprsB0V2N1 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprsB0V2N1 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprsB0V2N1 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprsB0V2N1 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprsB0V2N1 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprsB0V2N1 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprsB0V2N1 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprsB0V2N1 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprsB0V2N1 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprsB0V2N1 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprsB0V2N1 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprsB0V2N1 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprsB0V2N1 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprsB0V2N1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprsB0V2N1 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprsB0V2N1 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprsB0V2N1 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprsB0V2N1 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprsB0V2N1 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprsB0V2N1 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprsB0V2N1 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprsB0V2N1 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprsB0V2N1 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprsB0V2N1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprsB0V2N1 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprsB0V2N1 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprsB0V2N1 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprsB0V2N1 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprsB0V2N1 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprsB0V2N1 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprsB0V2N1 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprsB0V2N1 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprsB0V2N1 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprsB0V2N1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprsB0V2N1 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprsB0V2N1 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprsB0V2N1 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
PtprsB0V2N1 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
PtprsB0V2N1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtprsB0V2N1 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtprsB0V2N1 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtprsB0V2N1 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtprsB0V2N1 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtprsB0V2N1 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtprsB0V2N1 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtprsB0V2N1 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtprsB0V2N1 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtprsB0V2N1 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
PtprsB0V2N1 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
PtprsB0V2N1 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtprsB0V2N1 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtprsB0V2N1 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtprsB0V2N1 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtprsB0V2N1 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtprsB0V2N1 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtprsB0V2N1 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtprsB0V2N1 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtprsB0V2N1 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtprsB0V2N1 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtprsB0V2N1 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtprsB0V2N1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtprsB0V2N1 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtprsB0V2N1 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtprsB0V2N1 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtprsB0V2N1 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtprsB0V2N1 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtprsB0V2N1 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtprsB0V2N1 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtprsB0V2N1 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtprsB0V2N1 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
PtprsB0V2N1 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms