Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Nfyc-204ENSMUST00000120779 2006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tmem238A9JSM3 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms