Protein–RNA interactions for Protein: A3KFM7

Chd6, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 2,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd6A3KFM7 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd6A3KFM7 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd6A3KFM7 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd6A3KFM7 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd6A3KFM7 Isg20-203ENSMUST00000120331 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd6A3KFM7 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd6A3KFM7 Gm7211-201ENSMUST00000172692 1118 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd6A3KFM7 Mir133a-1hg-201ENSMUST00000179771 395 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd6A3KFM7 Mpzl1-203ENSMUST00000191818 853 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd6A3KFM7 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd6A3KFM7 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd6A3KFM7 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd6A3KFM7 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd6A3KFM7 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd6A3KFM7 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd6A3KFM7 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd6A3KFM7 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd6A3KFM7 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd6A3KFM7 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd6A3KFM7 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd6A3KFM7 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd6A3KFM7 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd6A3KFM7 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd6A3KFM7 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd6A3KFM7 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd6A3KFM7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd6A3KFM7 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd6A3KFM7 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd6A3KFM7 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd6A3KFM7 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd6A3KFM7 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd6A3KFM7 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd6A3KFM7 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd6A3KFM7 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd6A3KFM7 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd6A3KFM7 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd6A3KFM7 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd6A3KFM7 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd6A3KFM7 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd6A3KFM7 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd6A3KFM7 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd6A3KFM7 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd6A3KFM7 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd6A3KFM7 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd6A3KFM7 Gm16305-201ENSMUST00000140747 556 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd6A3KFM7 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd6A3KFM7 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd6A3KFM7 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd6A3KFM7 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd6A3KFM7 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd6A3KFM7 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd6A3KFM7 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd6A3KFM7 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd6A3KFM7 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd6A3KFM7 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd6A3KFM7 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd6A3KFM7 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd6A3KFM7 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd6A3KFM7 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd6A3KFM7 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd6A3KFM7 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd6A3KFM7 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd6A3KFM7 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd6A3KFM7 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd6A3KFM7 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd6A3KFM7 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd6A3KFM7 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd6A3KFM7 Wfdc3-202ENSMUST00000109328 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd6A3KFM7 Gm23675-201ENSMUST00000157311 125 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd6A3KFM7 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd6A3KFM7 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd6A3KFM7 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd6A3KFM7 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd6A3KFM7 A930036I15Rik-201ENSMUST00000196018 1045 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd6A3KFM7 Gm34312-201ENSMUST00000204650 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd6A3KFM7 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd6A3KFM7 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd6A3KFM7 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd6A3KFM7 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Chd6A3KFM7 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd6A3KFM7 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd6A3KFM7 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd6A3KFM7 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd6A3KFM7 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd6A3KFM7 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd6A3KFM7 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd6A3KFM7 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd6A3KFM7 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd6A3KFM7 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd6A3KFM7 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd6A3KFM7 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd6A3KFM7 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd6A3KFM7 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd6A3KFM7 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd6A3KFM7 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd6A3KFM7 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd6A3KFM7 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd6A3KFM7 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd6A3KFM7 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Chd6A3KFM7 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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