Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Atp8b5A3FIN4 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Atp8b5A3FIN4 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Atp8b5A3FIN4 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Atp8b5A3FIN4 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Atp8b5A3FIN4 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Atp8b5A3FIN4 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Atp8b5A3FIN4 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Atp8b5A3FIN4 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Atp8b5A3FIN4 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Atp8b5A3FIN4 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp8b5A3FIN4 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp8b5A3FIN4 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp8b5A3FIN4 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp8b5A3FIN4 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp8b5A3FIN4 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp8b5A3FIN4 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp8b5A3FIN4 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp8b5A3FIN4 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atp8b5A3FIN4 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp8b5A3FIN4 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp8b5A3FIN4 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp8b5A3FIN4 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp8b5A3FIN4 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp8b5A3FIN4 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp8b5A3FIN4 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp8b5A3FIN4 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp8b5A3FIN4 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp8b5A3FIN4 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp8b5A3FIN4 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp8b5A3FIN4 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp8b5A3FIN4 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp8b5A3FIN4 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp8b5A3FIN4 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp8b5A3FIN4 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp8b5A3FIN4 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atp8b5A3FIN4 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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