Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ttll9A2APC3 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms