Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GabreA2AMW3 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms