Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Frmpd4A2AFR3 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms