Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pramef6A2A8M8 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms