Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.2 ms