Protein–RNA interactions for Protein: V9GX34

Csmd2, CUB and Sushi multiple domains 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd2V9GX34 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csmd2V9GX34 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csmd2V9GX34 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csmd2V9GX34 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csmd2V9GX34 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csmd2V9GX34 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csmd2V9GX34 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csmd2V9GX34 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Csmd2V9GX34 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csmd2V9GX34 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csmd2V9GX34 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Csmd2V9GX34 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csmd2V9GX34 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Csmd2V9GX34 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csmd2V9GX34 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csmd2V9GX34 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csmd2V9GX34 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csmd2V9GX34 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csmd2V9GX34 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csmd2V9GX34 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csmd2V9GX34 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csmd2V9GX34 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csmd2V9GX34 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csmd2V9GX34 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csmd2V9GX34 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csmd2V9GX34 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csmd2V9GX34 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csmd2V9GX34 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Csmd2V9GX34 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csmd2V9GX34 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csmd2V9GX34 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csmd2V9GX34 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csmd2V9GX34 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csmd2V9GX34 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csmd2V9GX34 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Csmd2V9GX34 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Csmd2V9GX34 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csmd2V9GX34 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csmd2V9GX34 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csmd2V9GX34 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Csmd2V9GX34 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Csmd2V9GX34 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Csmd2V9GX34 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csmd2V9GX34 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csmd2V9GX34 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Csmd2V9GX34 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csmd2V9GX34 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csmd2V9GX34 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csmd2V9GX34 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csmd2V9GX34 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csmd2V9GX34 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csmd2V9GX34 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csmd2V9GX34 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csmd2V9GX34 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Csmd2V9GX34 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csmd2V9GX34 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Csmd2V9GX34 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csmd2V9GX34 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Csmd2V9GX34 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Csmd2V9GX34 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csmd2V9GX34 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csmd2V9GX34 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csmd2V9GX34 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csmd2V9GX34 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csmd2V9GX34 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csmd2V9GX34 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csmd2V9GX34 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csmd2V9GX34 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csmd2V9GX34 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csmd2V9GX34 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csmd2V9GX34 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csmd2V9GX34 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Csmd2V9GX34 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csmd2V9GX34 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Csmd2V9GX34 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Csmd2V9GX34 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Csmd2V9GX34 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Csmd2V9GX34 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csmd2V9GX34 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csmd2V9GX34 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csmd2V9GX34 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csmd2V9GX34 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csmd2V9GX34 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csmd2V9GX34 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csmd2V9GX34 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Csmd2V9GX34 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Csmd2V9GX34 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csmd2V9GX34 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csmd2V9GX34 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csmd2V9GX34 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csmd2V9GX34 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csmd2V9GX34 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csmd2V9GX34 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csmd2V9GX34 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csmd2V9GX34 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Csmd2V9GX34 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csmd2V9GX34 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csmd2V9GX34 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csmd2V9GX34 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csmd2V9GX34 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms