Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Homer1Q9Z2Y3 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.5 ms