Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

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Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Mrpl40Q9Z2Q5 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Mrpl40Q9Z2Q5 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
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Mrpl40Q9Z2Q5 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Mrpl40Q9Z2Q5 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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