Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Crlf3Q9Z2L7 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Crlf3Q9Z2L7 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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