Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E1

Mbd2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd2Q9Z2E1 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mbd2Q9Z2E1 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mbd2Q9Z2E1 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mbd2Q9Z2E1 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mbd2Q9Z2E1 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mbd2Q9Z2E1 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mbd2Q9Z2E1 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mbd2Q9Z2E1 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mbd2Q9Z2E1 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mbd2Q9Z2E1 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mbd2Q9Z2E1 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mbd2Q9Z2E1 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mbd2Q9Z2E1 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mbd2Q9Z2E1 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mbd2Q9Z2E1 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mbd2Q9Z2E1 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mbd2Q9Z2E1 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mbd2Q9Z2E1 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mbd2Q9Z2E1 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mbd2Q9Z2E1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mbd2Q9Z2E1 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mbd2Q9Z2E1 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mbd2Q9Z2E1 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mbd2Q9Z2E1 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Mbd2Q9Z2E1 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Mbd2Q9Z2E1 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Mbd2Q9Z2E1 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mbd2Q9Z2E1 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Mbd2Q9Z2E1 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Mbd2Q9Z2E1 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mbd2Q9Z2E1 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Mbd2Q9Z2E1 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mbd2Q9Z2E1 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mbd2Q9Z2E1 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mbd2Q9Z2E1 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mbd2Q9Z2E1 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mbd2Q9Z2E1 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mbd2Q9Z2E1 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mbd2Q9Z2E1 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mbd2Q9Z2E1 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mbd2Q9Z2E1 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mbd2Q9Z2E1 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mbd2Q9Z2E1 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mbd2Q9Z2E1 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mbd2Q9Z2E1 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mbd2Q9Z2E1 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Mbd2Q9Z2E1 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mbd2Q9Z2E1 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mbd2Q9Z2E1 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mbd2Q9Z2E1 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mbd2Q9Z2E1 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mbd2Q9Z2E1 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mbd2Q9Z2E1 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mbd2Q9Z2E1 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mbd2Q9Z2E1 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mbd2Q9Z2E1 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mbd2Q9Z2E1 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mbd2Q9Z2E1 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mbd2Q9Z2E1 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mbd2Q9Z2E1 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mbd2Q9Z2E1 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mbd2Q9Z2E1 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Mbd2Q9Z2E1 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mbd2Q9Z2E1 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mbd2Q9Z2E1 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Mbd2Q9Z2E1 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Mbd2Q9Z2E1 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mbd2Q9Z2E1 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Mbd2Q9Z2E1 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mbd2Q9Z2E1 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mbd2Q9Z2E1 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mbd2Q9Z2E1 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mbd2Q9Z2E1 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mbd2Q9Z2E1 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mbd2Q9Z2E1 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mbd2Q9Z2E1 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mbd2Q9Z2E1 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mbd2Q9Z2E1 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mbd2Q9Z2E1 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mbd2Q9Z2E1 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mbd2Q9Z2E1 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mbd2Q9Z2E1 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Mbd2Q9Z2E1 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Mbd2Q9Z2E1 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Mbd2Q9Z2E1 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Mbd2Q9Z2E1 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Mbd2Q9Z2E1 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Mbd2Q9Z2E1 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Mbd2Q9Z2E1 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Mbd2Q9Z2E1 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Mbd2Q9Z2E1 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Mbd2Q9Z2E1 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Mbd2Q9Z2E1 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Mbd2Q9Z2E1 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Mbd2Q9Z2E1 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Mbd2Q9Z2E1 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mbd2Q9Z2E1 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Mbd2Q9Z2E1 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Mbd2Q9Z2E1 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Mbd2Q9Z2E1 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms