Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Mbd3Q9Z2D8 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Mbd3Q9Z2D8 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms