Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2B9

Rps6ka4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka4Q9Z2B9 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps6ka4Q9Z2B9 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps6ka4Q9Z2B9 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps6ka4Q9Z2B9 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps6ka4Q9Z2B9 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps6ka4Q9Z2B9 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps6ka4Q9Z2B9 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rps6ka4Q9Z2B9 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6ka4Q9Z2B9 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6ka4Q9Z2B9 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6ka4Q9Z2B9 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6ka4Q9Z2B9 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6ka4Q9Z2B9 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6ka4Q9Z2B9 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6ka4Q9Z2B9 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6ka4Q9Z2B9 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6ka4Q9Z2B9 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6ka4Q9Z2B9 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6ka4Q9Z2B9 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6ka4Q9Z2B9 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6ka4Q9Z2B9 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6ka4Q9Z2B9 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6ka4Q9Z2B9 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6ka4Q9Z2B9 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6ka4Q9Z2B9 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6ka4Q9Z2B9 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6ka4Q9Z2B9 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6ka4Q9Z2B9 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6ka4Q9Z2B9 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6ka4Q9Z2B9 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6ka4Q9Z2B9 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rps6ka4Q9Z2B9 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6ka4Q9Z2B9 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6ka4Q9Z2B9 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6ka4Q9Z2B9 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6ka4Q9Z2B9 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6ka4Q9Z2B9 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6ka4Q9Z2B9 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6ka4Q9Z2B9 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6ka4Q9Z2B9 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6ka4Q9Z2B9 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms