Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Cldn8Q9Z260 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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