Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Lgr5Q9Z1P4 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Lgr5Q9Z1P4 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms