Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0H8

Clip2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip2Q9Z0H8 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clip2Q9Z0H8 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clip2Q9Z0H8 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clip2Q9Z0H8 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clip2Q9Z0H8 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clip2Q9Z0H8 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clip2Q9Z0H8 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clip2Q9Z0H8 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clip2Q9Z0H8 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clip2Q9Z0H8 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clip2Q9Z0H8 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clip2Q9Z0H8 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clip2Q9Z0H8 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clip2Q9Z0H8 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clip2Q9Z0H8 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clip2Q9Z0H8 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Clip2Q9Z0H8 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Clip2Q9Z0H8 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Clip2Q9Z0H8 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Clip2Q9Z0H8 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clip2Q9Z0H8 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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Clip2Q9Z0H8 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clip2Q9Z0H8 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Clip2Q9Z0H8 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clip2Q9Z0H8 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Clip2Q9Z0H8 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clip2Q9Z0H8 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clip2Q9Z0H8 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clip2Q9Z0H8 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Clip2Q9Z0H8 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Clip2Q9Z0H8 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Clip2Q9Z0H8 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Clip2Q9Z0H8 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clip2Q9Z0H8 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Clip2Q9Z0H8 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms