Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nme3Q9WV85 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nme3Q9WV85 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms