Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnip1Q9WUU8 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnip1Q9WUU8 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnip1Q9WUU8 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnip1Q9WUU8 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnip1Q9WUU8 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnip1Q9WUU8 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnip1Q9WUU8 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnip1Q9WUU8 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnip1Q9WUU8 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnip1Q9WUU8 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnip1Q9WUU8 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnip1Q9WUU8 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnip1Q9WUU8 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnip1Q9WUU8 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnip1Q9WUU8 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnip1Q9WUU8 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnip1Q9WUU8 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnip1Q9WUU8 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnip1Q9WUU8 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnip1Q9WUU8 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnip1Q9WUU8 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnip1Q9WUU8 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnip1Q9WUU8 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnip1Q9WUU8 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnip1Q9WUU8 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnip1Q9WUU8 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnip1Q9WUU8 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnip1Q9WUU8 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnip1Q9WUU8 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnip1Q9WUU8 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnip1Q9WUU8 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnip1Q9WUU8 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnip1Q9WUU8 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnip1Q9WUU8 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnip1Q9WUU8 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnip1Q9WUU8 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnip1Q9WUU8 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnip1Q9WUU8 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnip1Q9WUU8 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnip1Q9WUU8 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnip1Q9WUU8 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnip1Q9WUU8 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnip1Q9WUU8 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnip1Q9WUU8 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnip1Q9WUU8 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnip1Q9WUU8 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnip1Q9WUU8 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnip1Q9WUU8 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnip1Q9WUU8 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnip1Q9WUU8 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnip1Q9WUU8 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnip1Q9WUU8 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnip1Q9WUU8 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnip1Q9WUU8 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnip1Q9WUU8 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnip1Q9WUU8 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnip1Q9WUU8 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnip1Q9WUU8 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnip1Q9WUU8 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnip1Q9WUU8 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnip1Q9WUU8 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnip1Q9WUU8 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnip1Q9WUU8 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnip1Q9WUU8 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnip1Q9WUU8 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnip1Q9WUU8 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnip1Q9WUU8 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnip1Q9WUU8 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnip1Q9WUU8 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnip1Q9WUU8 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnip1Q9WUU8 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnip1Q9WUU8 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnip1Q9WUU8 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnip1Q9WUU8 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnip1Q9WUU8 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnip1Q9WUU8 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnip1Q9WUU8 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnip1Q9WUU8 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnip1Q9WUU8 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnip1Q9WUU8 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnip1Q9WUU8 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnip1Q9WUU8 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnip1Q9WUU8 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnip1Q9WUU8 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnip1Q9WUU8 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnip1Q9WUU8 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnip1Q9WUU8 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnip1Q9WUU8 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnip1Q9WUU8 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnip1Q9WUU8 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnip1Q9WUU8 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnip1Q9WUU8 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnip1Q9WUU8 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnip1Q9WUU8 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnip1Q9WUU8 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnip1Q9WUU8 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnip1Q9WUU8 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnip1Q9WUU8 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnip1Q9WUU8 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms