Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ8

Fam50b, Protein FAM50B, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50bQ9WTJ8 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam50bQ9WTJ8 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms