Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ubxn8Q9QZ49 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn8Q9QZ49 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn8Q9QZ49 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn8Q9QZ49 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn8Q9QZ49 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn8Q9QZ49 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn8Q9QZ49 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn8Q9QZ49 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn8Q9QZ49 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn8Q9QZ49 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn8Q9QZ49 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn8Q9QZ49 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn8Q9QZ49 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn8Q9QZ49 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn8Q9QZ49 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn8Q9QZ49 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn8Q9QZ49 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn8Q9QZ49 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn8Q9QZ49 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn8Q9QZ49 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn8Q9QZ49 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ubxn8Q9QZ49 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn8Q9QZ49 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn8Q9QZ49 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn8Q9QZ49 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn8Q9QZ49 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn8Q9QZ49 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn8Q9QZ49 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn8Q9QZ49 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn8Q9QZ49 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn8Q9QZ49 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn8Q9QZ49 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn8Q9QZ49 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn8Q9QZ49 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn8Q9QZ49 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn8Q9QZ49 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn8Q9QZ49 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn8Q9QZ49 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn8Q9QZ49 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn8Q9QZ49 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn8Q9QZ49 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn8Q9QZ49 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn8Q9QZ49 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn8Q9QZ49 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn8Q9QZ49 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn8Q9QZ49 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn8Q9QZ49 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn8Q9QZ49 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn8Q9QZ49 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn8Q9QZ49 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn8Q9QZ49 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn8Q9QZ49 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn8Q9QZ49 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn8Q9QZ49 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn8Q9QZ49 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn8Q9QZ49 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubxn8Q9QZ49 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn8Q9QZ49 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ubxn8Q9QZ49 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms