Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl39Q9JKF7 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms