Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS3

Smco4, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 59 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco4Q9JIS3 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smco4Q9JIS3 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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