Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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