Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESW8

Pgpep1, Pyroglutamyl-peptidase 1, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgpep1Q9ESW8 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Gm20854-201ENSMUST00000178889 1002 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 AC113082.2-201ENSMUST00000215876 756 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 4930584E12Rik-201ENSMUST00000216646 981 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Olfr1118-201ENSMUST00000121296 996 ntAPPRIS P2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Gm25026-201ENSMUST00000175017 188 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Gm39375-201ENSMUST00000217068 1039 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Gm35189-201ENSMUST00000219319 789 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 CT009713.1-201ENSMUST00000224828 853 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Pgpep1Q9ESW8 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms