Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES61

Ms4a4b, Chandra protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4bQ9ES61 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Obox1-206ENSMUST00000181001 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Gm26801-202ENSMUST00000193187 610 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Gm8920-201ENSMUST00000196153 924 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 AC125464.1-201ENSMUST00000228013 512 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Gm11342-203ENSMUST00000224879 1324 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Gm25414-201ENSMUST00000101814 107 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 0610043K17Rik-201ENSMUST00000123107 614 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Gm12637-201ENSMUST00000130501 368 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Gm28449-201ENSMUST00000187655 506 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Gm28269-201ENSMUST00000189511 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Gm37724-201ENSMUST00000195240 1221 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Gm42782-201ENSMUST00000197286 522 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Gm18996-201ENSMUST00000214851 755 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Gm35326-201ENSMUST00000218234 1041 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Gm40653-202ENSMUST00000222122 1155 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 AC162934.3-201ENSMUST00000223015 841 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Stap1-201ENSMUST00000031171 909 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Cd84-201ENSMUST00000042302 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Cntnap2-201ENSMUST00000060839 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ms4a4bQ9ES61 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms